舰船在无尽的拉格朗日中的优化搭配，其核心在于深刻理解并平衡舰队的火力输出、防御承伤与功能辅助等多重角色。一套完整的舰队构成应涵盖输出、防御、修复、防空与载机等五种基本定位，这是构筑任何有效战斗编队的基础前提。优化搭配并非追求单一舰船的极致性能，而是着眼于整个舰队体系的协同与互补，根据你所拥有的舰船蓝图，让它们各司其职，形成一个能应对多种战场情况的有机整体。其根本思路是让具备高护甲或闪避能力的防御型舰船置于前排，吸收并分摊主要火力，从而为中后排那些火力强大但相对脆弱的输出与支援舰船创造安全的作战环境。你需要密切关注敌方舰队的构成，动态调整己方配置，例如当对方空中力量薄弱时，可以减少防空单位的投入，将指挥值更多分配给对舰火力。这种针对性的动态调整，是舰队搭配从固定模板走向实战优化的关键一步。
理解舰船的内在站位系统是指挥官必须掌握的基础知识，每艘舰船在蓝图阶段就已确定了其属于前排、中排或后排。战斗中，敌方会优先攻击位于前排的我方舰船，因此将高防御的舰船编入舰队前排是保护核心力量的直接手段。在此基础上，你需要进一步研究舰船武器的攻击序列，该序列指明了武器优先攻击的舰船类型。虽然武器在实战中也可能攻击序列外的目标，但利用这一序列，你可以进行有针对性的克制，例如让战斗序列优先攻击驱逐舰的己方舰船去应对以斗牛级为主力的敌方舰队。另一个硬性约束是指挥值系统，它在你的基地达到九本后拥有400点的上限。你必须在此限制内进行权衡，大型舰船如战列巡洋舰和航空母舰虽然威力巨大，但会消耗大量指挥值，过度编入会导致舰队舰船数量过少，可能在小船的围攻中陷入被动。优化搭配意味着在指挥值消耗、舰船数量、生存能力与火力密度之间找到当前最适合你的平衡点。
武器系统的伤害机制深刻影响着舰船的选择与对抗策略，武器单发伤害若低于目标的护甲值，则只能造成极低的保底伤害。这要求你在强化舰船时，提升输出舰船的单发伤害至关重要。另能量武器是一个特殊类别，它能无视目标的物理护甲，其伤害效果取决于目标的能量护盾系统，这使得搭载离子炮等能量武器的舰船在面对高护甲目标时具有独特优势。防空机制也需要留意，游戏中大部分舰船的默认防空属于自体防空，即只在有敌方飞机攻击该舰船时才触发。只有少数舰船拥有可保护队友的区域防空能力，这使得针对性的防空配舰变得尤为重要。关于舰船强化，所有同蓝图下的子型号共享总计50级的等级上限与技术点，因此技术点的分配需有长远规划。幸运的是，强化系统提供了洗点功能，可以让你在需要时重新分配技术点，以适应不同的战术需求或舰船定位调整。
航空母舰与战列巡洋舰作为舰队中的高端力量，其搭配逻辑需要特别考量。航空母舰的核心价值在于其搭载的舰载机与护航艇，没有足够强力空中单位的航母，其作战效能将大打折扣。在选择航母时，应考虑其不同定位，例如偏重综合与输出的航母或偏重舰队维修与支援的航母，并根据战场需求搭配相应的战机与护航艇组合。战列巡洋舰方面，在未经针对性改造前，站位位于中排、能在前排掩护下安全输出的型号，通常比需要顶在前排承伤的型号更易于维护和使用。这些高价值单位在投入战斗时，务必确保它们处于一个由其他舰船构成的完善保护体系中，避免被敌方快速集火摧毁。
舰队的最终编组应服务于你的具体战略意图，这意味着你可以根据不同的战术目标组建功能特化的舰队。你可以成立一支专注于高速移动和攻城属性的拆家舰队，用于袭扰敌方的采矿平台与前哨站，这种非对称战术能有效牵制对手。维修型舰船在游戏前中期对抗非玩家舰队时效果显著，但在后期高强度玩家对决中，其维修量可能难以跟上战场损伤速度，因此需要根据实际情况判断是否编入主力。在高级作战中，还可以利用增援指令来临时突破舰队的指挥值上限，将强大的战巡或航母加入已出发的舰队，但需注意增援后整支舰队的航行模式可能改变，且需妥善保护这些核心增援单位。舰船的优化搭配是一个持续的、动态的过程，它要求指挥官不仅了解每艘船的特性，更能洞察战场全局，根据敌我变化和战略目标，灵活地将手中有限的资源组合成最有效的力量。
